前列腺癌是全球男性最常見(jiàn)的泌尿系統腫瘤。根據WHO數據庫 (GLOBOCAN) 數據顯示，每年有超過(guò)120萬(wàn)新發(fā)病例和35.8萬(wàn)死亡病例。其中，40-70%的轉移性去勢抵抗前列腺癌?(mCRPC) 患者存在PTEN基因缺失。日前，多個(gè)全球臨床試驗中發(fā)現AKT抑制劑對基于腫瘤組織PTEN基因拷貝數缺失的前列腺癌患者有明顯療效。然而，如何通過(guò)無(wú)創(chuàng )傷的檢測方法幫助前列腺癌患者鑒別出PTEN基因拷貝數缺失是前列腺癌臨床診療的剛需。
繼近期發(fā)表的JCOPrecision Oncology文章之后，慧渡醫療與天津醫科大學(xué)第二附屬醫院等合作在國際專(zhuān)業(yè)醫學(xué)雜志Frontiers in Oncology最新發(fā)表了新一代液態(tài)活檢的技術(shù)突破，解決了通過(guò)血液來(lái)檢測PTEN基因拷貝數缺失的國際科技難題。該技術(shù)有望為全球超過(guò)1100萬(wàn)前列腺癌患者帶來(lái)精準治療的福音。
Frontiers是一個(gè)領(lǐng)先的開(kāi)放訪(fǎng)問(wèn)發(fā)布的開(kāi)放科學(xué)平臺，是世界上最大、被引用最多的出版商之一，其中腫瘤學(xué)期刊2020年的影響因子為6.244。本次論文的合作單位還包括來(lái)凱醫藥和立迪生物。
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研究背景?
腫瘤組織取樣的局限性以及陳舊的腫瘤組織的不及時(shí)性，成為制約PTEN拷貝數缺失作為預測性的腫瘤生物標志物在精準治療發(fā)展中的瓶頸。在這項研究中，作者將慧渡醫療新一代液態(tài)活檢cfDNA技術(shù)，用于mCRPC患者包括PTEN拷貝數缺失在內的、RB1和TP53基因缺失的檢測，從基礎研究到臨床應用多個(gè)角度，探索基于血液的基因拷貝數缺失與患者預后的相關(guān)性。
研究方法和結果
通過(guò)PredicineCARE?技術(shù)分析15 名 ARPI 耐藥的mCRPC患者隊列（正交檢測驗證研究），檢測血液循環(huán)腫瘤DNA (ctDNA)?和組織腫瘤DNA (tDNA) 的變異特征。該研究采用低通量全基因組測序 (LP-WGS) 技術(shù)進(jìn)行驗證，同時(shí)，用免疫組織化學(xué) (IHC) 方法對組織樣本加以驗證。作者在患者血液ctDNA CNV特征中發(fā)現外周血液態(tài)活檢結果與組織活檢結果具有很好的一致性 (ctDNA>10%、tDNA>20%時(shí)，一致性高達81%)。
PredicineCARE? 給出的PTEN拷貝數缺失的檢測結果，與臨床金標準IHC及組織、血漿全基因組測序驗證的結果高度一致。
基于血液的 cfDNA 分析：對52例mCRPC患者血液樣本的變異圖譜分析發(fā)現，PredicineCARE?能精準檢測出PTEN、RB1和TP53基因的7類(lèi)變異類(lèi)型，其中CNL變異類(lèi)型在RB1和PTEN基因中占比非常高。
研究發(fā)現，存在拷貝數變異的患者總生存期 (OS) 更短 (RB1基因，mOS：29.4 VS 13.3個(gè)月；PTEN基因，mOS：27.8 VS 14.1個(gè)月)。
進(jìn)一步的分析結果顯示，同時(shí)檢測出PTEN、RB1 和 TP53多個(gè)拷貝數缺失的mCRPC患者，相比檢測出單基因CNL的患者總生存期 (OS) 更短 (TP53/RB1VS TP53+RB1, mOS: 18.1 VS 14.7個(gè)月; TP53/RB1/PTEN VS >=2個(gè)基因，mOS: 18.6 VS 14.5個(gè)月)。
結論?
作為男性泌尿系統第一高發(fā)腫瘤的前列腺癌，其中有40-70%的mCRPC患者有PTEN基因缺失。利用陳舊性腫瘤組織作為檢測途徑，多個(gè)全球臨床試驗研究發(fā)現，PTEN缺失的前列腺癌患者從AKT 抑制劑 (Afureserib, Ipatasertib, Capivasertib) 的靶向治療中獲益?；鄱舍t療對血液中PTEN基因拷貝數缺失的檢測，為全球上千萬(wàn)前列腺癌患者帶來(lái)精準靶向治療的新希望。
慧渡醫療在美國硅谷建立有完善的CLIA和CAP雙認證標準實(shí)驗室。通過(guò)中美兩地標準一致的檢測產(chǎn)品、統一化的實(shí)驗室運營(yíng)和質(zhì)量體系管理，為國內外藥企伙伴提供中美兩地統一標準化、相互數據可比的NGS液態(tài)活檢全球化、一站式精準診斷和醫學(xué)大數據整體解決方案。
目前慧渡醫療已完成多項腫瘤藥物治療相關(guān)的國際臨床合作研究，多篇文章發(fā)表在European Urology等影響因子大于17分的國際頂級學(xué)術(shù)期刊上。同時(shí)，慧渡醫療積極開(kāi)展伴隨診斷CDx全球布局，與多家全球領(lǐng)先的國際藥企深度合作，共同開(kāi)展中美伴隨診斷CDx 同步開(kāi)發(fā)、注冊申報。
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CirculatingCell-Free DNA-Based Detection of Tumor Suppressor Gene Copy Number Loss and ItsClinical Implication in Metastatic Prostate Cancer